牡丹江鐵路運輸法院始建于1981年。辦公樓建于1981年，辦公審判用房1657平方米。內設政治處、辦公室、立案庭、刑事審判庭、民事審判庭、審判監(jiān)督庭、執(zhí)行局、司法警察大隊。牡丹江鐵路運輸法院現(xiàn)有人員43名。其中：法官27人，平均年齡49.33歲，本科以上學歷占96.2%;其他工作人員16人，平均年齡40.25歲，本科以上學歷占68.75%。年平均辦案300余件。2008年被路局政法委評為全局政法系統(tǒng)人民滿意的政法單位標兵;2009年評為全省政法系統(tǒng)“大學習、大討論”暨正規(guī)化管理活動先進集體。