1946年12月，庫車地方法院成立，轄理庫車、沙雅、新和、拜城縣的刑事與民事案件，分設刑事庭、民事庭、檢察處、看守所，設院長、推事、書記長、書記員、首席檢察官等職，在編12人。民國37年(1948)5月25日，成立新疆高等法院庫車分院，承辦阿克蘇、焉耆兩個專區(qū)的二審刑事、民事案件，編制10人，附設監(jiān)獄。1950年5月1日，成立庫車縣人民法院，下設刑事庭、民事庭、看守所。文化大革命初，法院機構撤銷，1973年恢復。1980年組建8個基層法庭，1981年設經濟審判庭，1985年設執(zhí)行庭，1990年設行政審判庭。2012年庫車縣人民法院共設11個內設機構：立案庭、法警大隊、執(zhí)行庭、行政辦公室、政工科、監(jiān)察室、行政庭、民事庭、刑事庭、審監(jiān)庭、審管辦。五個基層法庭：阿拉哈格法庭、牙哈法庭、齊滿法庭、哈尼喀塘木法庭、墩闊坦法庭。