該所是依托鹽城市農業(yè)科學院、江蘇沿海地區(qū)農業(yè)科學研究所的人才技術優(yōu)勢依法成立的司法鑒定機構，技術力量雄厚，科研設施齊全。2002年經江蘇省高級人民法院批準，并報最高人民法院備案，在《人民法院報》上公告，成為面向社會的司法鑒定機構，編號為蘇鹽19001，鑒定范圍為農業(yè)科學技術(含農業(yè)技術經濟)司法鑒定。2003年經江蘇省司法廳批準成立鹽城市農業(yè)科學院農業(yè)技術司法鑒定所，并報司法部備案，在《新華日報》上公告，鑒定范圍為農業(yè)技術司法鑒定。2007年1月經江蘇省司法廳批準單位名稱變更為鹽城市農業(yè)科學院司法鑒定所，司法鑒定許可證號320907007，鑒定范圍為微量物證鑒定（農業(yè)技術）。2012年1月經江蘇省司法廳批準司法鑒定業(yè)務范圍變更為農業(yè)司法鑒定（農業(yè)技術鑒定、林業(yè)技術鑒定、園藝技術鑒定、種子農藥化肥鑒定、畜禽養(yǎng)殖技術鑒定、水產養(yǎng)殖技術鑒定、農業(yè)事故損害鑒定）?，F(xiàn)有執(zhí)業(yè)司法鑒定人15人。2009年、2010年分別被司法部表彰為“全國司法鑒定先進集體”、“全國法律服務先進集體”。