舟山市人民檢察院成立于1954年，始稱浙江省人民檢察署舟山分署，由時(shí)任舟山專署辦公室主任岳劍秋兼任代檢察長。1956年更名為浙江省人民檢察院舟山分院，田文吉任檢察長。1958年舟山專區(qū)撤銷，設(shè)置舟山縣，公、檢、法機(jī)關(guān)合署辦公，稱舟山縣政法機(jī)關(guān)檢察科，由趙祖章同志負(fù)責(zé)工作。1960年2月，公、檢、法三機(jī)關(guān)又分別設(shè)立機(jī)構(gòu)，舟山縣人民檢察院隨之建立，先后由王傳階、張德潤任檢察長。1963年3月，舟山恢復(fù)專區(qū)制，浙江省人民檢察院舟山分院隨之恢復(fù)?！拔母铩逼陂g，檢察機(jī)關(guān)工作中斷。1978年1月根據(jù)中央有關(guān)文件精神，重建浙江省人民檢察院舟山分院。1987年3月舟山撤地建市，改稱舟山市人民檢察院。舟山市人民檢察院現(xiàn)轄定海、普陀區(qū)檢察院，岱山、嵊泗縣檢察院。2002年機(jī)構(gòu)改革后，市院共設(shè)15個(gè)內(nèi)設(shè)機(jī)構(gòu)。